Amber mask语法：
① 冒号' : ' + 残基编号，表示匹配第几号残基。
若所匹配残基编号连续，用' - '连接；
若所匹配残基编号不连续，用' , '连接。
示例：
:15 #匹配第15号残基:1-10 #匹配1-10号连续的几个残基:2,7-9,25 #匹配2号、7-9号、以及25号残基
② 冒号' : ' + 残基名称
表示匹配全部的某类残基。
冒号' : ' + <string> + ' = ' , 匹配名字中以string 开头的残基。
示例：
:ARG #匹配所有的精氨酸:PRO,LEU,PHE #匹配所有的脯氨酸、亮氨酸、苯丙氨酸:AS= #匹配所有以名字中以AS开头的残基(以AS开头的残基有ASP、ASN)
③ ' @ ' + 原子序号
表示特定序号的原子被匹配上。
示例：
@15 #匹配第15号原子@1-10 #匹配1-10号连续的几个原子@2,7-9,25 #匹配2号、7-9号、以及25号原子
④ ' @ ' + 原子名称
表示特定名字的原子被匹配上。
' @ ' + <string> + ' = '
匹配名字中以string开头的原子。
示例：
@CA，N #匹配所有的原子名称为CA或N的原子@C= #匹配所有以名字中以C开头的原子(即所有的C原子)@H= #匹配所有以名字中以H开头的原子(即所有的H原子)
⑤ ' @% ' + 原子类型
表示特定类型的原子被匹配上。
示例：
CT #匹配所有(力场中定义的)原子类型为CT的原子 （这是一种标准的sp3杂化的碳原子））N*，N3 #匹配所有(力场中定义的)原子类型为N*或N3的原子#(N*是一种特殊的sp2杂化的碳原子，N3是一类sp3杂化的氮原子)
以上是amber mask基本选择模块部分，除此之外，它还可以配合逻辑操作符等进行更加灵活的原子选区：
几个逻辑操作符：
& 和| 或！ 取反/非
几个距离运算符：
<: #后面接数字，表示距离小于几A范围内的残基>: #后面接数字，表示距离大于于几A范围内的残基>@ #后面接数字，表示距离小于几A范围内的原子（注意是原子，不是残基！）<@ #后面接数字，表示距离大于几A范围内的原子（注意是原子，不是残基！）
示例：
= & !,C #匹配所有碳原子，但排除掉那些原子名称为CA及C的原子:1-3 | :5-7 #匹配1-3号残基的CA原子或5-7号残基的CB原子:CYS,ARG & !(:1-10 | ,CB) #匹配残基CYS及ARG，并排除掉1-10号残基或排除掉名称为CA、CB的原子:*& != #匹配所有残基但排除所有氢原子。另一种表达形式为 !=:5 <@4.5 #匹配距离5号残基4.5A范围内的所有原子(:1-55 <:3.0) & :WAT #匹配距离1-55号残基3A范围内的所有残基，这些原子还必须是水分子。
含有逻辑操作符的匹配选区遵循一定的运算顺序(类似小学生的'先乘除后加减')，依次是：
（）括号选区 距离选区 ！ & |除此之外，这些带有逻辑、距离运算符的匹配规则还可以进行简写，简写范式如下：
:{残基编号 / 残基名称}@{原子编号 / 原子名称 / 原子类型}示例：
:1-10@CA 等价于 :1-10 & @CA:1-10 & @CA 等价于 :LYS & @H=
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