1989年2月：崔健创作并完成《新长征路上的摇滚》，同时在大陆、香港、台湾出版发行，随后在台湾荣获双白金唱片奖，在香港获白金唱片奖。    

1989年3月：在北京展览馆举办“新长征路上的摇滚”演唱会，轰动京城。同年《一无所有》荣获人民日报，中国国际文化交流中心举办的新时期十年金曲奖，并获得优秀歌手奖。    

1992年：独立制作完成电视音乐片《快让我在雪地上撒点野》在美国荣获三项大奖。并得到国际MTV大奖。

1997年：崔健荣获“YMC”至尊榜总选‘97中国推荐榜至尊男歌手  。  

2001年：崔健荣获“英特尔创意特别成就奖”。    

2001年12月2日：崔健接受了荷兰驻中国大使馆大使颁发的克劳斯亲王奖。该奖项一年颁发一次，其对象是来自亚洲非洲拉丁美洲以及加勒比海地区的知识分子，崔健因其“音乐借鉴了中国传统诗歌的表现形式，与中国的社会文化紧密相连，表达了中国对世界青年的心声”（评委会语）而获该项大奖。    

2003年：崔健荣获第一届中国轻音乐学会“摇滚音乐贡献奖”。    

2004年9月26日：崔健在美国旧金山接受了“世界和平音乐大奖”，该奖项力在于鼓励和肯定优秀音乐艺术家为促进世界和平作出的杰出贡献及在音乐事业上的卓越成就。   

2004年10月10日：在由广州市政府主办的第一届“声响亚洲——录音技术与科学文化节”上，崔健凭借其作品“小城故事”荣获评委会大奖“优秀摇滚音乐录音奖”!

2006年7月18日：崔健及乐队出席了在广州举行的第六届华语音乐传媒大奖颁奖盛典,并获得了“华语音乐传媒大奖殿堂音乐家”奖项。

2013年10月5日：在意大利音乐之城sanremo，中国摇滚教父崔健荣获意大利最高荣誉音乐奖Premio Tenco 音乐奖，并与意大利殿堂级歌手Francesco Baccini合作出演，一首意大利语版<一无所有>令全场气氛达到高潮，中国摇滚震撼亚平宁半岛！为了中国摇滚！让更多人感受中国充满力量的音乐!

2014年：崔健作品《蓝色骨头》赢得罗马国际电影节特别推荐奖，第八届罗马国际电影节于当地时间11月16日晚间颁布了本届电影节的各项大奖，最终崔健执导的影片《蓝色骨头》赢得主竞赛单元特别推荐奖！评委会在宣布崔健作品获奖理由的时候说：“崔健是中国一个伟大的摇滚歌手，他用自己的勇气拍摄出他自己的第一部独树一帜的电影，祝贺他！”

2014年8月18日：崔健导演作品“蓝色骨头”喜获 第10届韩国堤川国际音乐电影节评委会大奖！电影节唯一的竞赛单元"World Music Film Today"更是汇聚了全球范围内年度最佳8部电影，评委们从8部入围影片中评出两项大奖—电影节大奖（the Grand Prize）以及评委会特别奖！

2015年10月31日：崔健获得第15届华语电影传媒大奖之“最佳新导演”！

2016年6月25日：崔健“光冻”专辑获得台湾金曲奖最佳录音专辑。

2016年11月25日：崔健获得2016华语金曲奖十项提名，五项大奖: 2016年度最佳编曲人崔健；2016年度最佳摇滚艺人；2016年度最佳国语专辑；2016年度最佳录音师；2016十大华语唱片“光冻”！

2017年8月29日：第17届华语传媒音乐大赏，崔健获三项大奖，专辑“光冻”获得年度国语专辑！最佳摇滚艺人；最佳国语男歌手。